Plataforma de análisis genómico para micobacterias

Genómica micobacteriana
convertida en evidencia
organizada

MYCOVIA integra control de calidad, detección micobacteriana, clasificación taxonómica y trazabilidad bioinformática en un entorno diseñado para estudios de tuberculosis y micobacterias no tuberculosas.

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FASTQ · fastp · MTBC · MAC · Abscessus · hsp65 · Reportes

Fotografía editorial de laboratorio: placa de Petri con colonias micobacterianas sobre fondo petróleo
FASTQ
fastp / QC
Detección myco
Grupos taxonómicos
hsp65 NTM
Reportes
Logs / ZIP

De la secuencia al reporte

Un flujo reproducible,
documentado en cada etapa

Cada análisis conserva la relación entre archivos, parámetros, resultados y evidencia, permitiendo revisar cómo se obtuvo cada hallazgo.

  1. 01
    Ingreso FASTQPares de lecturas empaquetados y asociados al caso.
  2. 02
    Control de calidad (fastp)Limpieza y métricas de integridad de lecturas.
  3. 03
    Señal humanaEstimación de fracción mapeada a referencia humana.
  4. 04
    Detección micobacterianaMapeo contra referencias micobacterianas combinadas.
  5. 05
    Grupos taxonómicosDistribución interpretada: MTBC, MAC, complejo abscessus y otros.
  6. 06
    hsp65 (NTM)Identificación de especie cuando la señal lo permite.
  7. 07
    Reporte y bundleSíntesis técnica, logs y descarga ZIP del caso.
Cultivo micobacteriano en atmósfera de laboratorio editorial
Diagrama del flujo analítico de FASTQ a reporte

Especialización

Una plataforma enfocada
en micobacterias

Caracterización genómica orientada a tuberculosis y micobacterias no tuberculosas, con interpretación por grupos y marcador hsp65 cuando aplica.

Textura microscópica editorial representando análisis genómico del complejo Mycobacterium tuberculosis

MTB / MTBC

  • Detección de ADN micobacteriano
  • Señal asignable al complejo M. tuberculosis
  • Distribución de lecturas por referencia
  • Síntesis en reporte técnico
  • Conservación de outputs para revisión
Visualización editorial de diversidad de micobacterias no tuberculosas

NTM

  • Identificación de especie vía hsp65
  • Grupos MAC y complejo abscessus
  • Contextualización taxonómica por idxstats
  • Hallazgos secundarios cuando hay señal
  • Criterios de identidad y longitud documentados

Control de calidad

Integridad de lecturas antes de interpretar

El pipeline ejecuta fastp sobre pares FASTQ y genera reportes HTML/JSON de calidad. La señal humana aporta contexto sobre composición de la muestra antes de la detección micobacteriana.

  • FASTQ emparejado
  • fastp — limpieza y métricas
  • Fracción mapeada a referencia humana
  • Salidas conservadas por caso
Composición editorial de paneles de análisis genómico con indicadores de calidad

Identificación taxonómica

De la detección a grupos interpretables

Las lecturas se mapean a referencias micobacterianas. El reporte agrupa señal en MTBC, MAC y complejo abscessus, y el marcador hsp65 puede proponer especie NTM cuando se cumplen umbrales de identidad y longitud.

  • Detección myco
  • idxstats interpretado
  • Grupos MTBC · MAC · Abscessus
  • BLAST hsp65 cuando hay secuencia suficiente
Textura celular editorial asociada a diversidad taxonómica NTM

Evidencia y trazabilidad

Archivos, logs y resultados auditables

Cada caso conserva inputs, work, outputs, log de ejecución y un bundle ZIP descargable. La revisión técnica puede reabrir SUMMARY, salidas técnicas e idxstats interpretado.

  • run.log por ejecución
  • SUMMARY y reporte técnico
  • Descarga ZIP del caso
  • Separación entre métricas e interpretación
Metáfora visual de registros genómicos estratificados y trazabilidad

Entorno de trabajo

Vista previa sanitizada
de la plataforma

Representación editorial basada en pantallas reales de MYCOVIA. Sin identificadores, sin datos de pacientes y claramente marcada como demostración.

MYCOVIA · Cases · demostración

Casos

  • DEMO-MTB-01DONE
  • DEMO-NTM-02RUNNING
  • DEMO-QC-03READY

Panel de caso

CASE: DEMO-MTB-01 Estado: DONE Refs: OK FASTQ: 2 % humano: 12.4 MYCO mapped: 18420 Grupo: MTBC hsp65: — Outputs: SUMMARY · TECH · idxstats Bundle: disponible

Demostración · datos ficticios

Ecosistema

Marcas del entorno

MYCOVIA opera junto a la infraestructura de AEGIS Systems y el grupo científico MXAIB.

Núcleo bioinformático
MYCOVIA
Infraestructura
AEGIS Systems
Grupo científico
Mexicana de Investigación y Biotecnología

Los resultados deben interpretarse junto con la información clínica, microbiológica y epidemiológica disponible.

Acceso

Organice la evidencia
de sus estudios genómicos

Acceda a un entorno diseñado para analizar, documentar y revisar estudios genómicos de micobacterias.

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